O Projeto Acalanto Natal surgiu inspirado no Projeto Acalanto São Paulo. Em 1996, Dr. Marcos Antônio, um dos fundadores do Projeto Acalanto São Paulo/SP esteve em Natal proferindo palestras e divulgou o trabalho que fazia junto ao Projeto Acalanto SP. Um grupo de pessoas resolveu comprar a causa e adotar o nome Projeto Acalanto Natal. Com o apoio do grupo paulista, foi fundado o Projeto Acalanto Natal. Participou, então, imediatamente do II Encontro Nacional de Adoção realizado Itapetininga - São Paulo, no ano de 1997. Em 1999, sediou o IV Encontro Nacional em Natal, que foi de extrema importância, pois nessa ocasião foi fundada a ANGAAD - Associação Nacional dos Grupos de Apoio à Adoção.
Desde então, o Projeto já realizou mais de 2.000 entrevistas com pais adotivos e biológicos em busca da adoção legal e já concluiu mais de 1.000 processos de adoção. No ano de 2013 a 2016, o Projeto Acalanto Natal pode auxiliar a criação de grupos de apoio à adoção, o Acalanto Fortaleza, Acalanto Sergipe, Acalanto Brejo Santo, Acalanto Rondônia e o AME - Grupo de Apoio a Adoção de São Luiz dando suporte e orientação para que o grupo iniciasse suas atividades.